1999年6月，北京市人民政府出具《关于同意设立北京中关村科技发展股份有限公司的通知》（京政办函[1999]79号），同意设立北京中关村科技发展股份有限公司，股份总数为30,000万股，股本总额为30,000万元。其中，北京住宅开发建设集团总公司27,000万股、北京市国有资产经营公司1100万股、北京市新技术产业发展服务中心500万股、北京实创高科技发展总公司500万股、联想集团控股公司300万股、四通集团公司300万股、北京北大方正集团公司300万股。同日，北京市国有资产管理局亦作出《关于北京中关村科技发展股份有限公司国有股权管理有关问题的批复》同意北京市住宅开发建设集团总公司以经评估并经确认的净资产作为投入与北京市国有资产经营公司、北京市新技术产业发展服务中心、北京实创高科技发展总公司、联想集团控股公司、四通集团公司、北京北大方正集团公司共同发起设立北京中关村科技发展股份有限公司。
1999年6月，北京中关村科技发展股份有限公司取得了北京市工商行政管理局核发了注册号为1100001042864的《企业法人营业执照》。并于当年7月在深交所挂牌上市。
2006年底至2007年初，中关村科技公司完成股权重组和股权分置改革，鹏泰投资、广东粤文、海源控股等企业收购了北京住总集团所持中关村科技公司的全部股权，公司从一家国有控股企业成功转变为由多种经营成分组成的现代股份制企业。
